报考条件不同：报考执业医师资格，必须具备高等学校医学专业本科及以上学历，且在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用（或实习）期满一年。中专或者专科学历，必须先考取执业助理医师资格，获取从业资格之后，大专学历需要从业2年的经历，中专学历则需要5年，才能报考执业医师。

　　考试范围和难易程度不同：执业助理医师和执业医师考试，考试均有分为实践技能考试和医学理论考试，在实践技能考核和医学综合笔试部分，执业助理医师考试的难度比执业医师低、考试大纲的掌握的事实范围也小。

　　执业级别不同：执业助理医师注册后只能在乡镇一级卫生院或村级卫生所执业，在其他等级机构需要执业医师指导下执业。执业医师在全国内地各个医疗机构注册后可以取得合法执业资格，拥有处方权。