首先就是事业单位工作人员“身份”的变化。没有了事业编制，也告别了公职人员的身份。晋升途径也不再参照职称，工龄甚至关系。在市场竞争的压力下，选人用人将转变为能力导向。因此对一些有活力，有冲劲的年轻人未必是坏事。需要注意的是，脱离了事业编制后，如果没有特殊的定向招聘的渠道，将失去政府机关内部遴选的机会，只能以社会人员的身份重新参加公务员或事业单位招聘考试。

　　其次待遇差异会变大。事业单位改为企业后，其工资管理制度将会更加灵活，不会像机关事业单位一样严格按照职称职级来划分等级待遇。流程和岗位级别决定了岗位工资、补贴档次、绩效工资档次等内容。而脱离的国家的财政支持，工作人员的薪酬待遇将极大程度取决于企业的效益好坏。如果改革后效益很好，那么首先以企业的身份从事经营更为灵活自由自主，不用受行政机关政府部门限制，对企业发展是好事，企业发展空间也会更大更大。其次财务管理更为灵活，这意味着职工待遇将更灵活，收入往往相比改企前会增加许多。

　　当然，“事转企”也意味着工作人员失去了“旱涝保收”的稳定，如果企业效益不好，或是在事业单位改企过程出现问题，比如改制中资产流失，业务骨干离职等等，最终承受损失的是原事业单位的职工。此外，失去编制后职工工作不再稳定，可以自由跳槽选择其他行业尖端企业，也可能随时面临失业的状况，企业如果在市场竞争中处于劣势，还会有走向破产的风险。