全额拨款事业单位和差额拨款事业单位在多个方面存在显著的区别，具体如下：

一、公益属性与职能差异

全额拨款事业单位

公益性质更为明显，本身不参与经营活动，不产生经济收益。

主要承担公益一类的事业职能，如中小学校、基础科学研究、社会科学研究、文化体育、公共卫生等。

差额拨款事业单位

虽具有公益服务项目，但自身通过服务和经营会产生一定的经济收益。

主要属于公益二类的事业单位，如高等学校、实用性的科研院所、文化演出单位、医院等。

二、经费来源与财务管理

全额拨款事业单位

经费来源全部由财政全额拨款，包括人员的工资、社会保险、办公经费等全部来源财政开支。

财政可以对其收入进行全面的管理和监控。

差额拨款事业单位

财政按照差额部分进行拨款，自身会产生一定的收入来源。

财政主要承担单位的人员费用，其他费用由单位自筹。

三、职业年金记账方式与人员待遇

全额拨款事业单位

工作人员的职业年金，单位缴费部分实行虚账管理，待工作人员退休时再由财政拨付记实。

工资福利待遇按照事业单位的工作人员工资管理办法执行，全部纳入财政预算，在财政预算的范围内支付。

差额拨款事业单位

无论是单位缴费部分还是个人缴费部分，职业年金都按照实账进行管理。

由于有一定的经营收入，除了基本工资以外，大部分收入来源于绩效工资，因此平均收入水平可能会高于全额拨款的事业单位。

四、稳定性与变动性

全额拨款事业单位

经费来源稳定，通常能够保持较高的服务质量和水平。

差额拨款事业单位

存在的变动可能性较大，经费来源相对不稳定，存在很多不确定因素。

综上所述，全额拨款事业单位和差额拨款事业单位在公益属性、经费来源、财务管理、人员待遇以及稳定性等方面都存在明显的差异。这些差异使得两类事业单位在运营方式、服务质量和人员激励等方面各有特点。